SMAN 3 PPU dirintis mulai bulan 01 Juli 2002 di Semoi 1 , Kec. Sepaku, Kab. Penajam Paser Utara, 10 km dari Kecamatan, sekarang Hijrah ke sepaku III 500 m dari Kecamatan Sepaku, 90 km dari DISDIKPORA PPU. Dikerjakan oaleh para Guru dan TU masih honor. Didukung oleh warga desa, Kecamatan, Kabupaten PPU, dan Pemerintah Pusat yang selalu memperhatikan segala kekurangan. Kami ucapkan terimakasih semoga berkah bermanfaat bagi kita semua.
